Aşırı miktarda sirke tüketimi sağlığa zararlı değildir. Nispeten güçlü bir asittir ve boğazı ve mideyi tahriş edebilir, diş minesine zarar verebilir, kemikleri zayıflatabilir ve böbrekleri süzebilir.
Alınırsa, doktorlar asit içeriğini azaltmak için sirkenin suyla seyreltilmesini tavsiye eder. Sirke ayrıca diüretikler ve insülin gibi ilaçlarla tehlikeli ilaç etkileşimleriyle de ilişkilendirilmiştir. Elma sirkesi bazı insanlar tarafından diyabet tedavisinde kullanılır; Kan şekeri seviyelerini düzenlemeye yardımcı olsa da, doktorlar diyabet ilacının yerine kullanılabilir. Obezite ile mücadelede halk ilacı olarak da alınmaktadır; Yine, doktorlar mantıklı bir diyet ve egzersiz için buna karşı uyarıyorlar.
