Portakal tohumları yenilebilir. Portakal, limon ve mandalina gibi narenciye tohumları az miktarda siyanür bileşiği içermesine rağmen, tipik bir portakalın tohumları zararlı olabilecek kadar toksin içermez.
Portakal tohumları smoothie'lerle harmanlanabilir, ancak en çok onları büyük miktarlarda yememek en iyisidir. Mandalina tohumları çok acıdır, çünkü daha fazla miktarda siyanür toksini vardır. Meyve tohumları bazı efsanevi tıbbi özelliklere sahip olsalar da, meyve tohumlarının kanseri tedavi ettiği iddiasını destekleyen bilimsel bir kanıt yoktur. Clementines, göbek portakalları ve satsumalar da dahil olmak üzere pek çok portakal çeşidi çekirdeksizdir.