Küflü elma suyu içmek, hafif bir mide rahatsızlığına veya bağırsak rahatsızlığına neden olabilir. Küflenmiş veya rengini değiştiren meyve suyu atılmalıdır.
Şişelenmiş elma suyunun, en iyi şekilde basılmasından sonra 2-3 ay raf ömrü vardır. Açılmamış konserve elma suyunun, basım tarihinden 6-9 ay sonra tüketilmesi güvenlidir.
Taze sıkılmış elma suyu buzdolabında 7 ila 10 günden fazla bekletilmemelidir. Yüksek şeker içeriğine sahip meyve suyu genellikle daha uzun bir raf ömrüne sahiptir.
Pastörize edilmemiş elma suyu içmek, gıda zehirlenmesi riski oluşturur. Pastörizasyon, meyve sularında ve sütte zararlı bakterileri öldürmek için kullanılır ve bu nedenle pastörize edilmemiş elma suyu, benzerlerinden daha erken kötüleşebilir.
