Peynir, mikrodalga güvenli bir kaba yerleştirilerek ve belli bir süre yüksek ateşte pişirilerek eritilebilir. Çoğu tarif belirli peynir türlerinin nasıl eritileceğine ilişkin talimatlar sunar.
Peynirleri eritirken tarif talimatlarını dikkatlice izleyin. Peynir çok uzun süre pişirilirse, lastiksi hale gelir. Aşırı pişirilmiş peynir, mikrodalga fırında pişirme süresinin yakından izlenmesi ile önlenir. Peyniri 15 ila 30 saniye aralıklarla pişirmek iyi bir ipucu. Bu şekilde, zamanlayıcı gerekirse ayarlanabilir.
Nacho gibi peynirli yemeklerin normal olarak mikrodalgada pişirilmesi yaklaşık bir iki dakika sürer.