Yaklaşık 100 bitki ve bitki türü kafein içerir. Kafein meyvelerde daha az bulunur, ancak kola fındık Guarana bitkisinin ve kakao ağacının meyvelerinden elde edilen tohumlarda olduğu gibi kafein içerir .
Guarana bitkileri, kahve çekirdeğinden daha fazla kafein konsantrasyonuna sahip tohumları olan küçük meyveler üretir. Çörek otu bitkisinin bazı türleri, kiraz denilen yenilebilir kırmızı ve mor meyveler üretir. Bu kirazlar kafein içeren tohumları içerir. Limon, greyfurt ve portakal bitkileri yapraklarında ve çiçeklerinde kafein içerir, meyvelerin kendisinde değildir.
Çiçekli bitkilerden gelen meyvelerin çoğu kafein içermez. Bitkilerde ve tohumlarda bulunan doğal olarak ortaya çıkan kafein, sık sık bitkileri bitkiyi yemekten caydırmak için bir savunma mekanizması görevi görür.
