Uygun miktarda kalsiyum içermeyen yeşil biberler siyah, kösele lekeler oluşturur. Bu duruma çiçeğin çürüğü denir. Yetersiz sulama, bitkinin topraktan yeterli miktarda kalsiyum emmesini yasaklar. Toprağa ilave kalsiyum eklemek, bitkinin yeterince su almaması durumunda yardımcı olmaz.
Olgunlaşma sürecinde, biberler çeşitli renkler gösterir. Biberin siyah bölgeleri deri gibi değilse veya yumuşak ve ezik ise, sadece farklı bir renge olgunlaşır. Biberlerin çoğu yeşile başlar ve kırmızı ya da sarıya dönmeden önce siyaha döner. Bazı biberler, genellikle siyah olarak adlandırılan mor bir renge olgunlaşır.
