Gıda kirlenmesinin genel nedenleri, yetiştirme, hasat, işleme, nakliye veya hazırlık aşamasında üretim sürecine giren bakteri, virüs ve parazitleri içerir. Özellikle zararlı kirlenmeye duyarlı yiyecekler, ham ve hazır - tüketilmeden önce pişmeyen ürünler gibi yiyecekler tüketin.
E. coli en yaygın kirleticilerden biridir ve kesim sırasında dışkı ile kirlenmiş az pişmiş sığır eti sonucudur. Yiyeceklerin salmonella ile çapraz kontaminasyonu, aşçıların çiğ et ve kümes hayvanlarını, araçlar veya yıkanmış eller kullanarak pişirdiği veya pişirilmiş veya yemeye hazır yiyecekleri işleyen ve tüketici için yiyecek zehirlenmesine yol açan mutfaklarda yaygındır.