Yeşil çay, uygunsuz bir şekilde saklandığında veya aşırı uzun süre saklandığında kötüleşebilir. Çaydaki bozulma belirtileri arasında, aroma veren doğal yağların buharlaşmasını gösteren aroma kaybı vardır. Ancak, bunlar kalite sorunlarıdır ve çayın güvenliğini etkilemez.
Yeşil çay tipik olarak altı ila 12 ay saklanabilir. Depolama süresini uzatmak için yeşil çay bir ila iki yıl boyunca dondurucuda saklanabilir. Yeşil çay, kirlenmenin ve nemin girmesini önlemek için sıkıca kapalı bir kapta saklanmalıdır. Demlendikten sonra yeşil çay dört ila altı saat içerisinde tüketilmelidir.