Soğanın kesin kökeni bilinmiyor. Soğan orta Asya kökenli olabilir, ancak sebze tüm dünyada yabani olarak da büyümüş olabilir. Soğanın ekimi 5.000 yıldan uzun bir süre önce Çin, İran ve Batı Pakistan'a kadar uzanıyor.
Soğanlar, dayanıklılıkları nedeniyle ekili en erken mahsullerden biriydi. Soğanın bozulmadan kış aylarına dayanması muhtemel. Sebzenin çeşitli iklimlerde ve toprak koşullarında büyümesi, taşınması ve kök salması da kolaydı.
3500 civarında, C.C., soğanları, saygı gördükleri Mısır'da ekiliyordu. Eski Mısırlılar, soğanı eşmerkezli halkaları nedeniyle soğanı sonsuzluğun sembolü olarak kullandılar. Mısırlılar firavunlarla birlikte soğan gömdüler ve soğan resimleri piramitlerde ve mezarlarda göründüler.