Hemen hemen süpermarketler ve peynir dükkanlarında satın alınabilecek tüm peynirler, glütensiz ürünlerden mümkün olduğu kadar yakındır; peynir mayası (sütü kesen bir enzim) ve bakteriler (sütü fermente eden).
Bir glütensiz diyet uygularken, her zaman glüten çapraz kontaminasyona karşı dikkatli olunmalı, ayrıca diğer maddeler peynirlere lezzet olarak eklendiğinde. Bira ve ruhla ıslatılmış peynirlerde yeni bir trend ortaya çıkıyor; örneğin, koyu bira veya İrlanda viskisi ile doldurulmuş İrlanda çedarı. Bunların her ikisi de, tatlandırdıkları peynirlere tehlikeli düzeyde glüten katmaktadır. Bu gibi durumlarda, bu tür peynirlerden herhangi birini tüketmekten kaçınmak için glüten alerjisi olanlara şiddetle tavsiye edilir.
Ek olarak, glüten alerjileri veya çölyak hastalığından muzdarip insanlar, glüten içeren bazı mavi peynir türlerinden endişe duymaktadırlar, çünkü bunları yapmak için klasik olarak kullanılan bakteriler, Penicillium roqueforti, geleneksel olarak çavdar, malt veya buğday bazlı dekstroz üzerinde yetiştirilir, hepsi glüten içerir. 2009 yılında Kanada Çölyak Derneği tarafından yapılan bir araştırma, glüten için bir grup mavi peynir test etti ve seviyelerin hepsinin saptanamayan bir seviye olan milyonda bir kısımdan az olduğunu buldu. Yine de çölyak hastalığı olan kişiler her zaman dikkatli davranmalıdır, bu nedenle satıcınızdan, satın almayı düşündüğünüz bir ürünün kökenleri hakkında mümkün olduğunca fazla bilgi isteyin.