Organik yer fıstığı, sentetik gübreler ve böcek ilaçları olmadan yetiştirilir. Çoğu organik yerfıstığı, kansere neden olan toksin mikotoksin Aflatoksin ve diğer küfleri taşıyan bir kalıp olan Aspergillus flavos ile mahsulün kirlenmesini en aza indirmek için New Mexico ve Arizona'nın kurak iklimlerinde yetiştirilir.
Organik fıstık yetiştiren çiftçiler, toprağı ve yer fıstığı bitkilerini sağlıklı tutmak için yenilikçi toprak yönetimi teknikleri ve agresif ürün rotasyonu kullanır. Hem organik yer fıstığı hem de organik olmayan yer fıstığı, tarladan pazara taşındığında küf veya diğer organizmalar tarafından kirlenme potansiyeline sahiptir. Yer fıstığı, küf, salmonella, E. coli ve diğer organizmaların yanlış kullanımı, işlenmesi ve depolanmasıyla da kirlenebilir.
