Açıldığında soğutulmuş domates suyunun raf ömrü 5-7 gün arasındadır. Bu meyve suyu oda sıcaklığında 2 saatten fazla bırakılmamalıdır.
Domates suyu, hava geçirmez bir kapta saklandığında derin dondurucuda bir yıla kadar sürebilir. Bu tür meyve suyunu dondururken, dondurulduğunda genleşmesini sağlamak için kabın içinde en az yarım inç boşluk bırakılması önemlidir.
Açılmamış domates suyunun uygun şekilde depolanması halinde 2 ila 3 ay raf ömrü vardır. Meyve suyunun sert ve kötü bir kokusu varsa veya renginde değişiklik varsa, atılması önerilir.