Chipotle, müşterilerin sipariş almak için çevrimiçi sipariş vermelerini sağlar. Kullanıcılar oturum açar veya bir hesap oluşturur ve Şimdi Sipariş Et düğmesini tıklayın. Chipotle ayrıca bir faks sipariş formu ve çevrimiçi grup siparişi ve cep telefonu kullanıcıları için de, Chipotle uygulamasında sipariş seçenekleri bulunmaktadır.
Sipariş sayfası, kullanıcıların eti, pirinci türünü, fasulyeyi ve soslarını seçerek kişiselleştirdiği entré seçenekleri sunar. Sayfada ayrıca yan yemekler ve içecekler de vardır. Kullanıcılar mağazada veya çevrimiçi olarak bir kredi kartı veya hediye kartıyla ödeme yapmayı seçiyorlar. Mağazada, siparişlerini çevrimiçi olarak sipariş veren müşteriler doğrudan teslim alım kaydına gidiyor.