Sirke ticari temizlik maddeleri kadar etkili olmasa da, bakteri ve virüsleri öldürebilen doğal bir dezenfektandır. Sirkenin dezenfeksiyon özellikleri, bileşiminin bir parçası olan asetik asitten gelir, ancak bu asit ayrıca bazı yüzey türlerine zarar verir, bu nedenle dikkatli kullanılmalıdır.
Sirke biyolojik olarak parçalanabilen, toksik olmayan ve ucuz olmanın avantajlarını sunar, bu nedenle çocuklar tarafından temizlik için bile kullanılabilecek kadar güvenlidir. Ancak her türlü bakteri öldüremez. Örneğin, İngiltere'deki araştırmacılar sirkenin grip virüsünü öldürdüğünü, ancak bazı salmonella türlerine karşı etkisiz olduğunu tespit etti.
Genel ev temizliği ve dezenfeksiyonu için, sirke için 50/50 su çözeltisi kullanın. Küf temizleme veya gözenekli yüzeyleri dezenfekte etme gibi bazı zorlu işler daha güçlü bir çözelti veya saf sirke gerektirebilir. Çoğu ev yüzeyinde kullanmak güvenlidir; ancak sirke, asitliği nedeniyle mermeri aşındırır. Çamaşır suyu ve sirkeyi karıştırmak toksik olan klor gazı oluşturduğundan kaçınılmalıdır.
