Biyoteknolojinin olası olumsuz etkileri, genetiği değiştirilmiş bitkilerden veya hayvanlardan türetilen yiyecekleri yiyen insanlar için riskleri ve genetiği değiştirilmiş bitkilerin doğal bitkilere ve ekosistemlere zarar verme riskini içerir. Ayrıca çiftçilerin endişesi vardır. 'şirketler, değiştirilmiş tohumları veya diğer tarımsal ürünleri tekelleştirdiğinde mali sıkıntı çekiyor.
Genetiği değiştirilmiş ürünler, tarımsal biyoteknolojinin ana ürünleridir. Diğer bir endişe, ineklerde enfeksiyonlara ve diğer sağlık sorunlarına neden olan yapay rekombinant sığır büyüme hormonu gibi hayvanlarda hormon kullanımıdır. İnsanlarda kanser ve diğer olası olumsuz sağlık etkilerinin yapay hormonlarla tedavi edilen hayvanlardan elde edilen gıda maddelerinin tüketilmesinden kaynaklanıp kaynaklanmadığına dair çalışmalar yetersizdir.
Genetiği değiştirilmiş ürünler, doğal bitkileri, genetiği değiştirilmiş polen ve genlerle kirletebilir, yeni virüs türleri veya yabani otları yaratabilir, doğal haşere kontrolünü bozabilir ve besin zincirine zarar verebilecek toksinlerle toprağı kirletebilir. Bu toksinler, tarım işçilerine, ailelerine ve genetiği değiştirilmiş mahsullerin yetiştirildiği topluluktaki diğerlerine zarar verebilir.
Çiftçilerin mahsullerini daha az sayıda, genetik olarak işlenmiş çeşitlerle sınırlamak, aynı zamanda bitkileri etkileyen hastalık ve kuraklıkta önemli olan biyolojik çeşitliliği de sınırlar. Bir ekosistemde daha az çeşit veya tür varsa, popülasyon, gıda tedarikinde önemli bir temel alanını silebilecek bir monokültür zararlılarına karşı daha savunmasızdır.
GDO'ların satıldığı bazı ülkelerde insanları ve çevreyi korumak için organizmaların gözetimi ve denetimi yeterli değildir.
