DNA'nın pirimidin bazları sitozin ve timindir. Bir pirimidin, DNA çift sarmalının bir basamağını oluşturmak için bir pürinle birleşir. DNA'nın yapı taşları olan nükleotitler, bir fosfat grubu, beş karbonlu bir şeker ve ya bir pürin veya bir pirimidin içerir.
Pürinler çift bir halkaya sahipken pirimidinler sadece bir tek halkaya sahiptir. Her pirimidin yapısı, sadece bir tip pürin ile bağlanacak kadar spesifiktir. Göstermek için, sitozin ve guanin çiftleşirken, timin adenin ile bir çift oluşturur. Pürinler birbirleriyle eşleşmez ve pirimidinler birbirleriyle eşleşmez. Bir pürinin sadece bir pirimidin ile eşleştirilmesi esastır, çünkü DNA molekülünün genişliğini tutarlı tutar.