Bitki ve hayvan hücreleri arasında hücre duvarı yapısı, plastidlerin varlığı veya yokluğu, lizozom ve merkezciller ve boşlukların şekli gibi birkaç temel fark vardır. bitki ve hayvan hücreleri arasında. Ancak, yalnızca ökaryotik olarak sınıflandırılan organizmalarda bulunurlar ve esas olarak merkezi organellerde bulunurlar.
Hücre duvarı yapısı, bitki ve hayvan hücreleri arasında önemli ölçüde değişir. Bitki hücrelerinde, duvarlar şekle sahiptir, ancak açıkça tanımlanmış ve katı bir yapıya sahip değildir; biyologlar bunu neredeyse mevcut duvarlara sahip olduğunu belirtiyorlar. Öte yandan, hayvan hücrelerinin, hücre zarlarının dışında hiçbir hücre duvarı yoktur. Bitki hücrelerinde, plastitler sitoplazmada bulunurken, hayvan hücreleri plastidlerden yoksundur. Hayvan hücrelerinin çoğu, öncelikle sitoplazmalarında bulunan lizozomları içerir. Bitki hücreleri tipik olarak lizozomlara sahip değildir; yaparlarsa, bu yapılar aynı zamanda sitoplazmalarında da bulunurlar. Santrioles adı verilen organeller bazı bitki hücrelerinde bulunur, ancak yalnızca düşük bitki çeşitlerinin hücrelerinde bulunur. Ancak merkezciller tüm hayvan hücrelerinde bulunur. Bitki ve hayvan hücreleri arasındaki son ana fark, bütün bitki hücrelerinin, jel benzeri hücre özü ile doldurulmuş, vaküol adı verilen yapılar içermesidir. Bazı hayvan hücreleri de vakuoller içerir; eğer varsa, bu boşluklar geçici ya da küçüktür ve sözleşmeye açıktır.
