Rekombinant DNA, genetik araştırma, klonlama, genetiği değiştirilmiş organizmalar oluşturma ve biyomedikal ürünler üretmek için kullanılır. İnsan tüketimi için insülin üretimi, insülin yapmak için rekombinant DNA'yı bakteri veya mayaya sokar. Bu, inekler veya domuzlardan insülin toplamak yerine insan insülini üretimine izin verir.
Rekombinant DNA, iki veya daha fazla kaynaktan yapay olarak oluşturulan herhangi bir DNA'yı belirtir. İnsülin gibi gen ürünlerini üretmek için rekombinant DNA kullanmanın bir yöntemi plazmitler üretmektir. Plazmidler, normal DNA kromozomuna yerleştirilmeden bakteri içerisine yerleştirilebilecek küçük dairesel DNA parçalarıdır. Plazmidler genellikle, ilgilenilebilecek bir genin yerleştirilebilmesi için kesilebilecek konumlara sahiptir. Örneğin, insülin oluşturulması insan insülini genini yerleştirilmiş bir plazmid gerektirir. Bu işlem, insülinin tipik kaynakları olan domuz veya inek ürünlerine alerjisi olan kişiler için rekombinant DNA kullanarak insülini daha güvenli kılar.
Gıda kullanımı için genetiği değiştirilmiş organizmalar yapmak için rekombinant DNA kullanıldığında, istenen gen bir plazmid içine sokulur. Bu plazmid daha sonra ilgili geni veya proteini üretmek için bakterilere eklenir ve bu gen bitkilere eklenir.
Rekombinant DNA ve klonlama, model organizmalara ilgi çekici genler eklemek için araştırmada kullanılır, böylece sonuç çalışılabilir.