Santa Barbara'daki Kaliforniya Üniversitesi'ne göre, protista ve mantarlar arasındaki temel fark, mantarların hayatta kalmak için aerobik solunum ihtiyacı duymalarıdır, oysa protistler oksijensiz bir anaerobik ortamda yaşayabilir. Başka ikisi arasındaki fark, protistlerin her zaman tek hücreli olmasıdır, ancak mantarlar zaman zaman çok hücreli olabiliyor.
Protistler ve mantarlar dünyadaki her şeyin organizasyonunda hem krallıktır. İşlev ve davranışları bakımından benzerler, ancak aynı zamanda farklılıkları var. Her ikisi de bitkileri ve hayvanları da içeren ökaryotların alanına aittir.
Protista krallığı, ototrofik ve heterotrofik olan üyelerden oluşur. Ototroflar vücutlarındaki kaynaklardan kendi enerjilerini üretebiliyorlar, heterotroflar hayatta kalmak için ihtiyaç duydukları enerjiyi elde etmek için dış kaynaklara güvenmek zorundalar. Başka hiçbir krallık hem heterotrofik hem de ototrofik olmayan üyelerden oluşmuyor.
Mantarlar, heterotrofiklerle daha yakından ilgili olsalar da, ototrofik veya heterotrofik olarak kabul edilemezler. Mantarlar krallığı üyeleri ölü veya besleyici materyal tüketerek onları saprofit yapar. Autotroph'lar gibi bu materyali kendi bedenlerinden alamazlar; bunun yerine onu dış kaynaklardan alırlar. Bununla birlikte, heterotrofların aksine, materyal ondan ihtiyaç duydukları enerjiyi aldıklarında canlı değildir.
