Organizmaların sınıflandırılmasında kullanılan başlıca özelliklerden üçü hücre yapısı, beslenme şekli ve hücresel özelliktir. Bu özellikler, bilim insanlarının organizmaların birbirleriyle nasıl aynı olduğunu ve her birinden nasıl farklı olduklarını belirlemelerine yardımcı olur diğer.
Bir organizmanın hücre yapısına göre sınıflandırılması, prokaryot mu yoksa ökaryot mu olduğunu belirlemek ve sonra Hawaii Üniversitesi'nden Dave Krupp'a göre organizmanın hücre duvarı veya diğer organelleri olup olmadığını belirlemek anlamına gelir.
Beslenme şekli, bir organizmanın yemeğini nasıl aldığını belirtir. Organizmalar ototroph veya heterotroph olarak sınıflandırılabilir. Ototroflar kendi yiyeceklerini yaratırken, heterotroflar hayatta kalmak için diğer organizmaları da yemelidir. Bir organizma ototrof ise, aynı zamanda bir fotoototroph veya kemoautotroph olarak da sınıflandırılabilir. Ohio Eyaletinden Stephen T. Abedon, fotoototrofların güneş ışığından enerji kullanarak kendi yiyeceklerini ürettiklerini açıklıyor. Kemoototroflar, elektron veren bileşiklerden elde edilen enerjiyi kullanarak besin üretir.
Selülerite, bir organizmanın kaç hücreye sahip olduğunu ve bu hücrelerin nasıl düzenlendiğini belirtir. Bazı organizmalar tek hücreli, bazıları ise çok hücrelidir. Gelişmiş organizmaların dokularda düzenlenmiş hücreleri vardır.
