Bakteriler tipik olarak, sindirim yardımcıları olarak işlev görebilen, ayrışmaya hastalık ya da yardım eden prokaryotlar adı verilen tek hücreli organizmalardır. Ökaryotların aksine, çekirdekleri yoktur. Bakteriler DNAlarını ve diğer genetik materyallerini sitoplazmalarında tek bir iplik halinde içerirler ve ikili bölünme adı verilen bir işlemle ürerlerler.
Bakteriler sıcak ve soğuk ortamlarda gelişebilir. Psychrophiles daha soğuk ortamları tercih eden bakterilerdir, termofiller ise sıcak ortamlarda gelişir. Aşırı termofiller, okyanus tabanında aşırı sıcak hidrotermal menfezlerin etrafında yaşayabilir.
Bir organizmanın sindirim sisteminde yaşayan bakteriler, sindirimi kolaylaştırmak için sert gıda maddelerinin parçalanmasına yardımcı olabilir. Bu bakteri türleri ayrıca atık ayrıştırıcıları olarak da önemli bir rol oynamaktadır.