Kömür madenciliği çevreyi çeşitli şekillerde etkiler: yeraltı kömür madenciliği metan gazı gibi toksinleri su yollarına ve atmosfere sokar ve yüzey kömür madenciliği ormansızlaşma ve erozyona katkıda bulunur. Kömür madenciliği, yerel su tablolarını değiştiren büyük miktarda suyun yerini almaktadır. Bu değişiklik, çevre ekosistemlerdeki organizmaları etkileyerek, akarsu ve göllerdeki akış hızını ve suyun hacmini değiştirerek balık, bitki ve su türlerinin sağlık ve büyüme oranlarını etkilemektedir.
Kömür madenciliği iki şekilde gerçekleşir: yüzey madenciliği ve yeraltı madenciliği. Her ikisi de çevreye tehdit oluşturur, ancak farklı şekillerde. Yüzey madenciliği öncelikle dağların tepesinde gerçekleşmektedir. Madencilik işlemlerinin kurulması, çoğu zaman geniş orman ve bitki örtüsünün açık bir şekilde kesilmesini gerektirir. Bu kaldırma habitatları rahatsız ediyor ve manzaraları değiştiriyor. Yiyecek ve barınak için bu ormanlara bağımlı hayvanlar taşınmalıdır. Büyüme için bu toprakları gerektiren bitkiler tür kaybına uğrarlar.
Yüzey madenciliğinden kaynaklanan enkazlar genellikle yakındaki akarsu ve su yollarında sona erer ve sonuçta kirliliğe neden olur. Toprakları ve yaşam alanlarını tahrip etmenin yanı sıra, kömür madenciliği metan ve yangınlar üretiyor. Kömür yangınları, küresel ısınmaya katkıda bulunan gazlar da dahil olmak üzere atmosfere toksin verir. Yeraltı madenciliği faaliyetlerinin bir yan ürünü olan Metan, atmosfere yönelik bir tehdit oluşturuyor. Bu gaz iklim değişikliğini hızlandırarak karbondioksit gibi diğer gazlardan daha güçlü ve güçlü olduğunu kanıtladı.