Bir kobalt atomu her zaman tam olarak 27 proton içerir. Bir atomdaki protonların sayısı, elementin atom numarası olarak listelenen periyodik tablodaki girişinin sol üst köşesinde bulunabilir. . Kobalt'ın atom numarası 27'dir.
Kobalt ayrıca 27 elektron taşır. Elektronların negatif yükü, atomlar için net bir sıfır yükü oluşturmak için protonların pozitif yükünü tam olarak dengeler. Kobaltın, sadece bir tane stabil izotop, kobalt 59 olduğu bilinmektedir.