Kimya numarası 1: Atomlar ve Moleküller'in yazarı MJ Farabee'ye göre, atom numarası atom çekirdeğindeki proton sayısıdır. Proton sayısı, bir elementin kimliğini tanımlar. ve çekirdeği kaç elektron çevrelendiğini belirler. Bir elementin kimyasal davranışının çoğunu belirleyen bu elektronların düzenlenmesidir.
Atom sayısını arttırmak için düzenlenmiş periyodik bir tabloda, benzer kimyasal özelliklere sahip elementler doğal olarak aynı sütun veya grupta sıralanır. Örneğin, Grup 1A'daki bütün elementler nispeten yumuşak metallerdir, suyla şiddetli reaksiyona girerler ve 1+ yük oluşturur; Grup 8A'daki bütün elementler oda sıcaklığında reaktif olmayan monatomik gazlardır. Diğer bir deyişle, kimyasal elementlerin özelliklerinin kütlelerin artmasıyla periyodik olarak tekrarlanması söz konusudur.
Dimitri Mendeleev tarafından 1869'da yayınlanan orijinal periyodik tabloda, elementler artan atom kütlesine göre düzenlenmiştir. O zaman, çekirdek henüz keşfedilmemişti ve atomun iç yapısının hiçbirinde bir anlayış yoktu; bu nedenle, atomik kütle kullanılacak tek kılavuzdu. Çekirdeğin yapısı anlaşıldığında, elementlerin özelliklerini yöneten atom numarası olduğu anlaşıldı.