Bulunan protonların sayısı bir atomdur, atom numarası olarak adlandırılır. Bu numaraya proton numarası da denir.
Atom numarası, çekirdeğin şarj sayısı ile tam olarak aynıdır ve kimyasal bir element tanımlayan benzersiz bir sayıdır. Bir atom yüklenmemişse veya pozitif veya negatif bir yüke sahip değilse, atom numarası elektronların sayısıyla da aynıdır. Atom numarası bazen atomun çekirdeğinde bulunabilecek toplam proton ve nötron sayısı olan atom kütlesi ile karıştırılır.
Periyodik tablodaki her element, atomda bulunan elektronların sayısı veya atom numarası nedeniyle ayırt edilebilen belirli bir kimyasal özelliklere sahiptir. Atom numarası ayrıca Z numarası olarak da adlandırılır. Z sembolü, atom numarası da olan Almanca Atomzahl kelimesinden gelir.
Bir atomdaki nötronların sayısına N-numarası veya nötron numarası denir. Hem nötron sayısı hem de atom numarası tam sayılar olarak ifade edilir. Bir atom aynı atom numarasına, ancak farklı bir nötron sayısına sahipse, buna bir izotop denir.
