Tek hücreli organizmalar fagositoz adı verilen bir işlemle yemek yerler. Bu işlem, tek hücreli organizmanın yiyecekleri sindirim için hücrenin iç kısmına getirmesini sağlar.
Tek hücreli organizmanın yüzeyinde ve ayrıca istenen gıdada kimyasalların bir kombinasyonu, organizmanın gıdaları tanımasını ve kendisini yemeye çalıştığı maddeye bağlamasını sağlar. Eklendikten sonra organizma, dış hücre zarı adı verilen dış tabakasını tamamen gıda parçacığının etrafına sarmaktadır. Yiyecek dış hücre zarı tarafından sarıldıktan sonra, zar hücrenin içine doğru çırparak, vakuol adı verilen yemeği içeren hücrenin içinde bir kese oluşturur. Birlikte vakü ve yiyecek fagozom denir.
Fagosom daha sonra bir lizozomla temas eder. Bir lizozom, enzimler içeren bir vakuoldur. Lizozom daha sonra bu enzimleri fagozomun içine enjekte eder ve içeri girdikten sonra enzimler, yiyeceği ayrı ayrı moleküllere böler. Yiyeceklerden yalnızca bireysel organizmalar kaldığında, sindirildiği veya yenildiği kabul edilir. Bu moleküller daha sonra, tek hücreli organizmanın ihtiyaç duyduğu her şeyi yakmak ve inşa etmek için kullanılabilir.