Endüstriyel madenciliğin en büyük dezavantajı, madencilik faaliyetlerinin çevreye vereceği zarardır. Büyük toprak alanlarının kaldırılması habitatları tahrip edebilir ve madencilik faaliyetlerinde kullanılan kimyasallar yer altı sularına sızabilir alan. Hava kirliliği ve radyoaktif kirlilik diğer olası olumsuzluklardır.
Bir başka potansiyel tehlike jeolojik dengesizliktir. 1980'de Louisiana'daki Peigneur Gölü'nün altındaki bir tuz madeni, bir petrol sondaj operasyonu madenin bir bölümünü kırarken çöktü ve sonuçta ortaya çıkan çöküntü mavnalarda, araçlarda ve binalarda emildi. Göl yerleştikten sonra, tüm kıyı şeridi ve bölge çöküşle birlikte büyük ölçüde değiştirildi.
