Bir hücrenin çekirdeği bir ksenobiyotik madde tarafından zarar görürse, hücrenin bölünmesini önleyebilir ve diğer sorunlara yol açabilir. Çoğu durumda, hasar sonunda hücrenin ölümüne neden olur.
Çekirdeğin kendisinin potansiyel olarak hasar görmesine ek olarak, çekirdeğin içinde bulunan genetik makyaj da kendi başına zarar görebilir. Bu durumda, genellikle hücrenin hücre bölünmesini düzenleyen fonksiyonun normal kontrolünü kaybetmesine neden olarak hücrenin bölünmeye ve bir neoplazm haline gelmesine neden olur.
Çekirdeğin kendisi, nükleotitler, enzimler, nükleoproteinler ve DNA ve RNA'nın depolandığı çekirdeğin içindeki yoğun bir alan olan hücre nükleolus gibi çok sayıda farklı parça içerir. Çekirdek hücre metabolizmasını, bölünmesini ve protein sentezini kontrol ettiğinden ve genetik bilgiyi işlediğinden, çekirdeğe verilen herhangi bir hasar bu fonksiyonların herhangi birini kolayca etkileyebilir. Çekirdekteki DNA UV ışınları tarafından zarar görürse, tipik olarak RNA sentezinin baskılanmasına neden olur ve ayrıca hücrenin nükleotit eksizyon onarımını başlatmasına neden olur.Çekirdeğe zarar vermenin yanı sıra, hücrenin hücre zarı veya mitokondri gibi diğer yapılarına da zarar vermek sayısız soruna neden olabilir ve potansiyel olarak hücrenin ölümüne yol açabilir.
