EMB agar ve MacConkey agar, farklı ve seçici ortamlardır. EMB agardaki seçici bileşenler eozin ve metilen mavisi boyalardır, kristal mor boya ve safra tuzları MacConkey agardaki seçici bileşenlerdir. Laktoz, her iki ortamdaki diferansiyel bileşendir.
EMB agar ve MacConkey agardaki seçici bileşenler, Gram-pozitif mikroorganizmaların büyümesini inhibe eder, fakat Gram-negatif türlerin büyümesine izin verir. Mikroorganizmalar, enerji için ortamda bulunan laktozu fermente etme kabiliyetlerine bağlı olarak farklılaşmaktadır.
Laktoz fermente edici mikro-grencikler EMB agar üzerinde siyah ve bazen de parlak koloniler üretirken, laktoz olmayan fermenterler açık pembe veya renksiz koloniler üretir. Laktozun fermentasyonundan asit üretimi, koloni yüzeyinde EMB agar içindeki boyaların çökelmesine ve böylece belirli renk değişikliklerine yol açmaktadır.
MacConkey agar kullanılırken, laktoz fermente edici mikroorganizmalar kırmızı ila pembe renkli koloniler üretirken, laktoz olmayan fermenterler şeffaf veya renksiz koloniler üretir. Laktoz fermenterleri, ortamda agarın pH'ını düşüren ve renk değişimlerine neden olan bir asit üretir. Laktoz olmayan fermenterler, amonyak üreten laktoz yerine pepton kullanır. Bu, MacConkey agarının pH'ını yükselterek renksiz veya beyaz kolonilerin oluşumuna yol açar.
EMB agar ve MacConkey agar, koliformların idrar, su, dışkı ve diğer malzemelerden izolasyonu ve karakterizasyonu için kullanılabilir.