Çemen otu tohumları bir bütün olarak yenebilir, filizlenmiş veya toz haline getirilebilir, veya bir sos veya bir macun olarak yenebilir. Güçlü aromalı tohumlar, Orta Doğu, Hint, Akdeniz ve Asya mutfağında lezzetli yemeklere lezzet katmak için kullanılır. Tohumlar keskin, acı, yanmış şeker bir tada sahiptir.
Tohumlar sert ve küçüktür ve hardal rengi sarıdır. Güçlü tadı nedeniyle az miktarda yenilmelidir. Tohumları derin kızartmak tadı yumuşatır. Tohumların elle öğütülmesi zordur, bu nedenle bir kahve değirmeni mevcut değilse, önceden öğütülmüş tohumları satın alın. Bir tanesi bütün tohumları kilerdeki hava geçirmez bir kapta bir yıla kadar saklayabilir. Ancak, öğütülmüş çemen tohumlarını soğutmak gerekir.
