Bitki ve hayvan hücreleri, membranlara ve benzer hücre iskeleti elemanlarına bağlı organeller gibi çeşitli yapısal benzerlikleri paylaşır. Aynı zamanda çekirdekler, lizozomlar ve peroksizomlar gibi benzer membranlar ve nitelikler içerirler.
Bitki ve hayvan hücreleri arasındaki diğer bir önemli benzerlik, her ikisinin de ökaryotik hücreler olmasıdır. Ökaryotik hücreler karmaşıktır ve hücrenin farklı bölümlerini farklı işlevlere atamak için gelişmiş yöntemlere sahiptir. Verilebilir, organellerin ökaryotik hücrelerde farklı rolleri yerine getiren hücre bölmeleri olduğunu belirtir. Mitokondri organel enerji üretmek için gıda moleküllerini kullanır. Endoplazmik retikulum, proteinleri taşır ve membranların üretilmesine yardımcı olur. Lizozomlar, diğer organellerin yanı sıra makromoleküllerin de geri dönüşümünü sağlar.
Bir bitkinin veya hayvan hücresinin çekirdeği, hücrenin beyni ile karşılaştırılabilir. Scitable, çekirdeğin belki de tüm ökaryotik organellerin en önemlisi olduğunu belirtir. Membran bağlı bir çekirdeğin varlığı gerçekte About.com'a göre bir ökaryotik hücrenin tanımıdır. Çekirdek, bir bitkinin veya hayvan hücresinin genetik materyalinin çoğunluğunu içerir ve bu bilgiyi DNA moleküllerine düzenler. Çekirdek ayrıca kromozomlar oluşturur. Çekirdek ayrıca bir bitkinin veya hayvan hücresinin kontrol merkezi olarak görev yapar ve tüm faaliyetlerini düzenler.
