Bitki klonlamanın artıları: hastalıklara dirençli bitkileri çoğaltır, bitkilerde üremeyi hızlandırır ve besin değeri yüksek bitkileri çoğaltır. Bitki klonlamanın eksileri şunlardır: pahalıdır, özel beceriler gerektirir, genetik olarak aynı bitkileri çoğaltır ve klonlama yoluyla çoğaltılan bitkilerin ömrü kısadır.
Bitki klonlaması üremeyi hızlandırır, çünkü bitkilerin döllenme için gamet oluşum sürecinden geçmesi gerekmez. Ayrıca çiftçilerin, böcek ilaçları ve herbisitlerin kullanımını en aza indiren ve hastalık salgınları durumunda ekonomik kaybı en aza indiren hastalıklara karşı dirençli bitkileri yetiştirmelerini sağlar. Klonlama yoluyla üretilen bitkiler, kaliteleri ve besin değerleri bakımından geliştirilmiştir. Bu bitkiler, aralarındaki faydalı özellikleri koruyarak, besin değerlerinin zaman içinde korunmasını ve geliştirilmesini sağlamak için test edilir.
Bitki klonlaması, yetenekli insan gücü, modern teknoloji, özel ekipman ve köklendirme hormonları, doku kültürünü kolaylaştırmak için özel büyüme ortamı ve aşılamada kullanılacak belirli ana kökler gibi benzersiz malzemeler gerektiren pahalı bir süreçtir. Klonlama aynı zamanda genetik olarak aynı bitkiler üretir, bu nedenle bitki çeşitliliği kaybolur ve hastalık salgınları durumunda, klonlanan bitkilerin etkilenmesi muhtemeldir. Klonlama yoluyla çoğaltılan bitkilerin normal döllenme işlemi ile üretilenlere kıyasla kısa bir ömrü vardır.