Tohum çimlenme süreci, bitkilerin cinsel üremesiyle yaratılan embriyonik bitkinin, yeni ve bağımsız bir bitki oluşturarak türleri çoğalttığı karmaşık bir işlemdir. Çimlenme için nem ve sıcaklıklar, haklı olmak. Yeni bitkiler tohumda depolanan şekerler üzerinde kısa süre yaşar ve bitkinin topraktan besinleri ve nemi toplamasını ve hızlı bir şekilde kendi yemeğini üretmesini gerektirir.
Bir bitki bir tohum ürettiğinde, koşulların çimlenme için doğru olduğunu algılayana kadar hareketsiz kalır. Tüm tohumlar çimlenmek için su, doğru sıcaklık ve oksijen gerektirir. Su, tohumun çimlenmesi için gereken metabolik işlemleri başlatır. Tohumda depolanan şekerlerin kullanılması, oksijen gerektiren bir işlem olan solunum gerektirir. Toprak çok ıslaksa, tohum gereken oksijeni alamaz ve çimlenmez. Tohumlar donma derecesinin altına düştüğünde tohumlar çimlenmez. Bazıları çimlenmek için tam ışık gerektirirken, bazıları ise karanlık gerektirir.
Uygun koşullar oluştuğunda, tohum tohum kabuğundan içinden su ve oksijen alır. Hücreler daha da büyümeye başlar, sonunda tohum kabuğunu kırarlar. Kök önce ortaya çıkar, ardından kök ve yaprakları içeren sürgün gelir.