Beyaz ve kahverengi sirke arasındaki fark ilgili bileşenlerinde yatmaktadır. Beyaz sirke, malt veya mısır gibi fermente alkollerden yapılır. Ancak kahverengi sirke, birçok başka olası kaynağa sahiptir.
Kahverengi sirke, elma sirkesi, malt sirkesi, kahverengi pirinç sirkesi ve balzamik sirkeyi içerir. Elma sirkesi gibi bazıları açık veya orta kahverengi tonlarındayken balzamik sirke siyah görünecek kadar karanlıktır.
Beyaz ve kahverengi sirkelerin çeşitli kullanımları vardır. Lezzet profili çok düz olduğu için beyaz sirke, temel olarak temizlik ve yağ giderme maddesi olarak kullanılır. Huffington Post'a göre, kahverengi sirke daha yoğun ve karmaşık lezzet profillerine sahip ve mutfak kullanımı için ideal. Örneğin, malt sirkesi, İngiliz klasiğinin "balık ve cips" olarak adlandırılan tabaklarının üzerine serpilmiş geleneksel çeşnidir. Balzamik sirke, salata sosu, et cilaları ve birçok sosun popüler bir bileşenidir. Elma sirkesi başka bir salata sosu elyafıdır ve sağlık toniklerinde ve çeşitli evde sağlık ilaçlarında da popüler bir maddedir.
Diğer sirkelerin niş uygulamaları vardır. Örneğin, koyu mor umeboshi sirkesi Japon umeboshi eriklerinden gelir ve makrobiyotik adanmışlar arasında bir tarikat vardır. Diğer bir uzmanlık sirkesi, hamur tatlısı soslarında ve çorbalarda sıkça kullanılan mürekkep sirkesi olan Çin siyah sirkesidir.