Apoenzimler, koenzimlerle birleştirerek ve bir substrat için sistem spesifikliği oluşturarak aktif enzim sistemleri oluşturan proteinlerdir. Bu senteze girmeden önce, genellikle etkisizdir; koenzim veya kofaktör ile birleştirilmeden önce, aynı zamanda bir zymogen veya proenzim olarak da bilinir. Bazı durumlarda, orijinal hal, bir apoenzim olarak nihai yapısına geçmeden önce ortaya çıkan birkaç fazladan amino asit içerir.
Bir apoenzim, daha büyük bir enzimin yapısının sadece bir parçasıdır. Enzim aktivitesi belirli bir protein zincirine dayanır. Kofaktörler veya koenzimler her zaman organik değildir, ancak genellikle bir vitaminden gelirler. Bununla birlikte, farklı bir kofaktör tipi, bir metal iyon aktivatörüdür. İnorganik, metal iyonları genellikle koordinat kovalent bağları ile birleşir. Mineraller için gerekli olan beslenmenin arkasındaki amaç, diğer kutup atomlarıyla birleştirildiğinde enzim oluşturan vücut iyonlarını vermektir.
Apoenzimler kofaktörlerle farklı tiplerde ilişki oluştururlar. Çoğu durumda gevşek bağlar vardır ve ikisi sadece bir reaksiyon gerçekleştiğinde bir araya gelir. Diğer durumlarda, kovalent bağlar bunları sıkıca bir arada tutar. Kofaktörün amacı, yapısını değiştirerek veya reaksiyonun kendisinde yer alarak proteini aktif duruma getirmektir. Enzimin etki ettiği molekül substrattır.
