Asit yağmura maruz kalan bitkiler zarar görebilir, bu da hastalıklara karşı savunmasız kalmanın yanı sıra, büyümesini küçük bitkilerde bile ölüm noktasına kadar engellemiş olabilir. Asit yağmuru havanın bir sonucu kükürt dioksit veya azot oksit seviyeleri çok yükseldiğinde ve yağmura PH seviyesini düşürdüğünde kirlilik.
Asit yağmuru yapraklarla temas ettiğinde, bakteri ve virüslerin bulaşmasını önleyen ve bitkilerin yapısal bütünlüğünü sağlam tutan koruyucu mum katmanlarını temizleyebilir. Yağmur doğrudan zarar vermese bile, hava, doğa veya böceklerin zarar görmesine veya tahrip olmasına neden olur. Asit yağmuru ikincil etkisi toprağa sızmasıdır. Asidik toprak, besinleri etkili bir şekilde sağlayamaz, bu da yeterli besin yoksa bitkilerin büyümesini durdurabilir veya tamamen öldürür.
