Su kirliliği çeşitli mekanizmalarla ortaya çıkabilir, ancak en yaygın nedenler endüstriyel atıkları ve atık suları, tarımda nehirlere akan toksik maddelerin kullanımı ile birlikte su kütlelerine boşaltmaktır. ayrıca yanlışlıkla yağ dökülmeleri gibi su kirliliğinin daha az yaygın nedenlerindendir.
Su kirliliği, genel olarak su kütlesine giren herhangi bir toksik madde olarak tanımlanmaktadır. Toksik olarak sınıflandırılan bir maddenin, hem sudaki vahşi yaşamı hem de çevresindeki bitki yaşamını çevreleyen ekosistem üzerinde olumsuz sağlık etkileri vardır. Temiz su insan, bitki ve diğer hayvan yaşamı için çok önemlidir, bu nedenle su kirliliğinin incelenmesi ve azaltılması için önem taşımaktadır.