Tipik bir soğan hücresi laboratuarında, öğrenciler soğan hücrelerinin yapısını mikroskop kullanarak gözlemler. Öğrenciler laboratuvarı genellikle düşük güçte ve yüksek güçte büyütme kullanarak tamamlarlar.
Laboratuarın başında, her öğrenci bir soğanın iç zarının ince bir dilimini kullanarak bir slayt hazırlar. Örnek bir slayt üzerine yerleştirilir ve bir damla su veya leke eklenir. Katlanmayı veya kırışmayı önlemek için soğan dilimi üzerine bir kapak kayma yerleştirilir. Öğrenciler, numuneyi mikroskop altında inceler, hücre büyüklüğü ve şeklini, görünür hücre sayısını ve tespit edilebilir hücre yapılarını gözlemler.