Midede uygun şekilde sindirilmeyen yiyecekler en sonunda gastrointestinal sistemin geri kalan kısmı boyunca itilir ve vücuda dışkı olarak rektumdan çıkar. Vücut, sindirilmeyen yiyecekleri midenin parçalamadığı diğer maddeler gibi ele alır.
Vücudun gıdalardan besinleri tam olarak çıkaramaması malabsorpsiyon olarak bilinir. Bu, sindirim enzimlerinin yetersizliği veya kıtlığı nedeniyle oluşabilir. Malabsorpsiyon belirtileri arasında ishal, kilo kaybı ve rahatsız edici derecede büyük ve rahatsız edici dışkı vardır. Doktorlar, dışkıları yağ açısından inceleyerek olası emilim bozukluğunu test eder. Bazı durumlarda ince barsakların biyopsisi gereklidir.