Safra karaciğerde üretilir, ancak safra kesesinde depolanır. Karaciğerdeki hepatositler adı verilen özel hücreler safra yapar. Safranın birçok bileşeni arasında safra tuzları, su, bikarbonat iyonları, bilirubin, fosfolipitler ve kolesterol bulunur.
Safra, vücudun yağları emmesine ve sindirmesine yardımcı olan ve belirli atık türlerinden kurtulmasını sağlayan sarımsı yeşil bir maddedir. Her gün karaciğerde yaklaşık 500 ila 600 mililitre safra üretilir. Safra, açlık döneminde karaciğerden safra kesesine kistik kanal yoluyla geçer. Bir öğün tüketiminden sonra ve sindirim sırasında, safra safra kesesinden safra kanalından ince bağırsaklara geçer. Normalde safrayı safra kesesinin içine akmasını engelleyen büzme yapan Oddi sfinkteri, safranın ince bağırsağa girmesine izin vermek için rahatlar.