Oksijen eksikliği veya hipoksi, çok çeşitli tıbbi ve çevresel faktörlerden kaynaklanabilir. Dışarıdan, oksijen eksikliği genellikle yüksek irtifada olanlar gibi düşük oksijenli ortamlara maruz kalmanın sonucudur. Bu nedenle FAA, pilotların, About.com'a göre, günde 10.000 feet'in üzerindeki ve gece 6.000 feet'in üzerindeki irtifalar için ek oksijen kullanmasını önermektedir.
Hipoksi, ortamdaki sadece oksijen miktarına bağlı olmayan faktörlerden kaynaklanabilir. About.com, beyne ve diğer organlara zayıf veya yetersiz oksijen akışı ile sonuçlanabilecek birkaç tıbbi durum örneği sunar. Hipoksik hipoksi, kanda yetersiz solunumdan kaynaklanabilecek düşük oksijen durumunu tanımlar. Anemik hipoksi, kanın, birçok farklı durumun neden olabileceği oksijen taşıma kapasitesinin azaltılmış kapasitesine karşılık gelir. Durgun hipoksi, oksijen bakımından zengin kan dokularını aç bırakan zayıf kan dolaşımı gerektirir. Histiotoksik hipoksi, oksijeni etkin bir şekilde alamayan veya metabolize edemeyen hücrelerle dokuların kendileri üzerinde etki eder. Son olarak, sepsis ve diğer koşullar, oksijenin etkili bir şekilde alındığı ve taşındığı metabolik hipoksiye neden olabilir, ancak vücudun oksijene olan ihtiyacı, akciğerlerin besleme kapasitesinin ötesine yükselir.
