Nükleotidler iki tür bağla bir arada tutulur: fosfodiester bağları ve hidrojen bağları. Education Portal, fosfodiester bağlarını nükleotitleri doğrusal zincirlere bağlayan bağlar olarak tanımlar. Cambridge Physics'e göre, hidrojen bağları iki paralel nükleotit sırasını bağlayan bir köprü görevi görüyor. Bu bağlantı, DNA'nın kendine özgü çift sarmal yapısının oluşumuna yardımcı olur.
Wikipedia, bir nükleotidin, beş karbonlu bir şeker, bir azot bazı ve bir veya daha fazla fosfat grubundan oluştuğunu belirtir. Bir nükleotidin beş karbonlu şeker kısmı, yüksek oranda reaktif olan iki serbest hidroksil grubu içerir. Fosfat grupları da reaktifdir ve bağlanacak bir yer ararlar. Eğitim Portalı, fosfodiester bağlarının bir nükleotiddeki bir fosfat grubu ile komşu bir nükleotiddeki bir serbest hidroksil grubu arasında oluştuğunu belirtir.
Her bir nükleotidin azot bazı her zaman zincirin aynı tarafı boyunca sıralanır. DNA'da, ikinci bir nükleotit zinciri, birincisine paralel olarak çalışır, ancak oryantasyonu 180 derece döndürülür. Bu, azot bazlarının DNA yapısının merkezinde buluşmasını sağlar. Vikipedi, iki nükleotit grubunu bir arada tutan hidrojen bağlarının sadece baz çiftleri arasında oluştuğunu belirtir. Baz çiftleri, bir kural olarak birbirine bağlanan iki farklı azot bazını tanımlar.
