Noktasal olmayan kaynak kirliliği, tarımsal kimyasalları, hayvansal atıkları ve kentsel akışı içerir. Fabrika gibi tek bir kaynaktan çıkan kirliliğin aksine, nokta kaynaklı olmayan kaynak kirliliği birçok farklı yerden gelir. Yağmurdan akan su, kirletici maddeleri akarsulara, göllere ve nehirlere taşır.
EPA'ya göre, 2010'da nokta kaynaklı olmayan kaynak kirliliği, su kalitesiyle ilgili sorunların başında geliyordu. Her birey, çoğu zaman farkına varmadan, noktasal kaynaklı olmayan kaynak kirlenmesinde rol oynuyor. Çok fazla gübre, çok fazla bitki öldürücü veya ekinlerine çok fazla kimyasal madde ekleyen çiftçiler yakındaki akarsularda kirliliği arttırır. Hayvancılık atıkları kimyasal ve bakteri kirliliğini arttırmaktadır.
Kentsel alanlarda, birçok kaynaklı olmayan kaynak kirliliği türü, yüzey sularını etkiler. Çim kimyasallarının yanlış kullanılması da problemde rol oynar. Araçlardan yağ veya yakıt sızıntısı akımlara karışıyor. Yeni inşaat, akarsularda toprağı ve tortuyu arttırır. Hayvan atıklarını temizleyemeyen hayvan sahipleri, su kalitesini düşürmesine izin verir.
Noktasal olmayan kaynak kirliliği, kirlettiği suya tortu, besin maddeleri, toksinler, kimyasal maddeler ve patojenler ekler. Canlı bir akımı, artık yaşamı desteklemeyecek olana dönüştürebilir. Noktasal olmayan kaynak kirliliğini kontrol etmek, katkıda bulunan herkes için birleşik bir çaba gerektirir.