Japonya’nın doğal kaynakları arasında balık, tarım ve az miktarda metal ve mineral bulunur. Japonya, özellikle bölgede çok az doğal kaynağa sahip olmasına rağmen, güçlü bir sanayi çıktısı ve yüksek bir yaşam standardı elde etmekte önemli Doğal enerjinin.
Japonya, ülkeye balık ve diğer deniz ürünleri sağlayan önemli kıyı sularına sahiptir. Ancak, balığa olan talep o kadar yüksektir ki, yurt dışından yapılan ithalatlarla takviye edilmesi gerekmektedir. Japonya'nın az miktarda ekilebilir alanı olmasına rağmen, ülke, her yıl kendi gıdalarının yüzde 60'ından fazlasını üreten, dünyadaki en yüksek mahsul verimine sahiptir. Ülke yeterli miktarda altın, gümüş ve magnezyum kaynağına sahip, ancak demir cevheri ve bakır gibi gelişen elektronik endüstrisi için gerekli olan minerallerin çoğunu ithal etmeli.
Özellikle ülkenin doğal kaynakları arasında eksik olan herhangi bir doğal enerji kaynağıdır. Japonya, kuzey Honshu ve Hokkaido bölgelerinde küçük petrol sahaları ile ülke petrolünün yüzde 1'inden daha azını tedarik eden neredeyse hiçbir fosil yakıt kaynağına sahip değil. Japonya, dünyanın en büyük ikinci kömür ve sıvılaştırılmış doğal gaz ithalatçısıdır ve aynı zamanda en büyük ikinci petrol ithalatçısıdır. Bu kıtlığın bir sonucu olarak, Japonya, dünyanın en büyük hidroelektrik endüstrilerinden birine sahip olan, güç kaynağı olarak geniş su kaynağını kullanmaktadır.