Eubakteriler, klamidya, E. coli ve siyanobakteriler içeren büyük, çeşitli prokaryotik mikrop krallığıdır. Eubakteriyel organizmalar peynir ve şarap yapımında kullanılır. İnsanlarda ciddi enfeksiyonlara neden olabilirler ve bazen, insan bağırsak florasındaki gibi, yararlıdan zararlıya hızla değişirler.
Eubakterilerin tümü prokaryottur. Bunun anlamı, bitki ve hayvan krallıkları kadar geniş ve çeşitli olan bu krallığın üyelerinin, hücre çekirdeğinden yoksun olmaları ve ökaryotları tanımlayan simbiyotik ilişkiler olmadan enerji üretmeleridir.
Bir çeşit eubacteria olan siyanobakteriler, fosil kayıtlarında ortaya çıkan en eski yaşam formları arasındadır. Sömürge stromatoforları 3 1/2 milyar yıl önce Dünya'da stromatolitler adı verilen büyük höyükler inşa ediyordu. Bu mavi-yeşil algler, sıklıkla adlandırıldıkları gibi, Dünyadaki ilk büyük oksijen üreticileriydi ve Dünya atmosferinin dengesini korumak için merkezi kalırlar. Bazı siyanobakteriler azotu doğrudan havadan korur, toprağı zenginleştirir ve bitkilerin gelişmesine izin verir.
Zararlı eubakteriler parazit olarak bulunur. Chlamydia ve sifilizden sorumlu spiroketler, tahrip edici eubakterilerin iki örneğidir. E. coli tartışmalı bir başka zararlı basildir. Bu tür normal olarak sindirime yardımcı olduğu bağırsakta bulunur, ancak bazı durumlarda tehlikeli olabilir. Vankomisine dirençli E. coli hastane servislerinde sık rastlanan bir enfeksiyondur.
