İnce bağırsağın ana bölümleri vardır: duodenum, jejunum ve ileum. Duodenum, bağırsaktaki midenin hemen ardından bulunan ince bağırsağın ilk kısmıdır. Jejunum duodenumu takip eder ve ileum, kalın bağırsağın hemen önünde bulunan ince bağırsağın son kısmıdır.
Duodenum veya ince barsakların ilk kısmı, mideden, pilorik sfinkter olarak bilinen sıkı bir kas bandı vasıtasıyla sindirim sistemi içeriğini alır. İnce bağırsağın bu kısmı yaklaşık 10 inç uzunluğundadır ve pankreas ve safra kesesinden alınan sindirim enzimlerinin ince bağırsağa boşaldığı bölgedir. Mide içeriği duodenuma girdiklerinde çok asidiktir. Pankreastan yapılan bikarbonat, sindirim içeriğini nötralize etmek ve asidin duodenal astara zarar vermesini önlemek için duodenuma salınır.
Kısmen sindirilmiş yiyecekler, duodenum içinden peristalsis olarak bilinen dalgalı kas kasılmalarıyla jejunumun içine itilir. Jejunum uzunluğu 3 ila 6 feet arasındadır ve kimyasal sindirim ve besin maddelerinin emiliminin çoğunun meydana geldiği ince bağırsağın bir parçasıdır. Duodenumun sonuna geldiğinde, kısmen sindirilmiş yiyecek, yaklaşık 6 - 12 feet ileum arasında ilerler, ince sindirim ve emilimin meydana geldiği ince bağırsağın geçmiş kısmı. Daha sonra ileoçekal sfinkter ile kalın bağırsağa boşaltılır.