Fermentasyon, kullanılabilir enerjiyi üretmek için metabolizmanın ilk aşaması olan glikolizi uzatırken, anaerobik solunum metabolik çevrimi tamamlamak için oksijen dışındaki molekülleri kullanır. Hücre, oksijen yokluğunda. Anaerobik solunum, fermantasyondan daha fazla enerji üretir, ancak çok özel durumlarda daha az organizma tarafından kullanılır.
Fermantasyon, yeterli oksijen yokluğunda gıdalardan enerji elde etmenin oldukça yaygın bir yoludur. Birçok mikroorganizma, maya üreten etanol gibi fermantasyon veya laktik asit üreten hayvan, mantar veya bakteri hücreleri gibi fermentasyon kullanır. Laktik asit fermantasyonu, bir insan gibi bir hayvanın, kaslarını veya temin edebileceği oksijenin ötesindeki diğer işlevleri yerine getirmesi gerektiğinde gerçekleşir. Hücreleri daha sonra NADH molekülünü NAD iyonuna dönüştürmek için az miktarda ATP üretimine izin vermek için glikoliz kullanır. Bu işlem normal hücresel solunumlara göre çok verimsizdir.
Anaerobik metabolizma, birçok hayvan bağırsak yolundaki bakteriler dahil olmak üzere çoğunlukla bakterilerde bulunur. Bu organizmalar metabolik çevrimlerini tamamlamak için oksijen dışındaki elektron alıcılarını kullanır. Bağırsak organizmaları genellikle bir elektron alıcısı olarak karbon dioksit kullanır. Bu şekilde karbon dioksit kullanılması, organizmaya bağlı olarak metan veya asetik asit üretir.
