Fakültatif anaerobik bakteri örnekleri arasında salmonella ve E. coli bulunur. Fakültatif anaerobik bakteri, Enterobacteriaceae, Vibrionaceae ve Pasteurellaceae taksonomik ailelerinin üyeleridir. Bu ailelerdeki türlerin çoğu insanlarda, diğer hayvanlarda veya bitkilerde patojendir.
Fakültatif anaerobik bakteriler, hem aerobik solunum hem de fermantasyon veya anaerobik solunum yapabilirler. Bakterilerin yanı sıra birçok organizma, fakültatif anaeroblardır ve bazı mantar ve politaete kurtları içerir. Fakülatif anaerobik bakteriler her yerde bulunur ve toprakta, suda ve organizmalarda yaygındır. Bütün türler hastalığa neden olmaz, ancak hayvanların normal bağırsak florasının bir parçasıdır. E. coli gibi bazı türler genellikle zararsızdır.
Enterobacteriaceae, yaygın gıda kaynaklı bakteri salmonella ve E. coli'yi ve diğer birçok tehlikeli patojen grubunu içeren ailedir. Vibrionaceae türleri, vibrio kolera, kanalizasyon ve bulaşmış yiyeceklerden geçen ölümcül bir hastalıktır. Bu tür bağırsaklara yüksek miktarda su salınımına neden olarak hızlı dehidratasyona neden olur. Vibrionaceae ayrıca ışık üreten ve bazı derin deniz balıklarının ışık üreten organlarında bulunabilen bir grup olan fotobakteri içerir. Pasteurellaceae, evcil hayvanların ortak patojenleri olan pastuerella türlerinin yanı sıra, üst solunum yollarında sık görülen ve hayatta kalmak için hemoglobinin bir bileşenini gerektiren hemofilus türleri içerir.
