Atomlar ve moleküller arasındaki ilişki, moleküllerin atomlardan oluşma şeklidir. İki veya daha fazla gruptaki atomlara molekül denir.
Atomlar yaşamın temelidir ve herhangi bir elementin en küçük kısmıdır. Her şey atomlardan oluşuyor ve bir atomdan daha küçük bir şey yok. Bir atomdan daha küçük olan herhangi bir şey artık orijinal öğenin bir parçası değildir. Çoğu, hepsi değilse, atomlar iki veya daha fazla gruplar halinde birlikte kalır. Moleküller adı verilen bu gruplamalar, elemanları farklı bileşenlerin karmaşık bir birleşimi yapan şeydir.
Moleküllerin daha büyük ve daha iyi elemanlar oluşturmak için yaptıkları birçok farklı şey vardır. Moleküllerin bir kombinasyonu birlikte bir bileşik oluşturur. Örneğin su, hidrojen ve oksijen elementlerinden oluşur ve bu onu bir tür bileşik yapar. Bileşikler, karmaşık sistemlerdir çünkü bunlar iki veya daha fazla atomdan oluşan iki molekülden oluşan bir elementtir. Bir şeyin bir atom, bileşik veya molekül olup olmadığını belirlemenin kolay bir yolu, atomların moleküller haline gelinceye kadar genellikle adlarının bulunmamasıdır. Moleküller genellikle hidrojen veya oksijen gibi isimlere sahiptir ve su gibi gerçek isimleri olan şeyleri yapmak için birlikte oluştururlar.