Çekirdek, hücrenin sitoplazmasındaki protein sentezini, çekirdekte bulunan genetik kodların proteinleri oluşturmak için bir araya getirilen amino asitlerin sırasını belirlemesi anlamında kontrol eder. protein çekirdeği tarafından doğrudan kontrol edilirken, hücre içerisindeki diğer mekanizmalar ve yapılar, hangi proteinlerin gerekli olduğunu tespit etmekten sorumludur. Çekirdek, bir protein kod veritabanı olarak hizmet eder.
Hücre çekirdeği, bir zarla çevrili, sarılmış kromozomlardan oluşan bir gruptur. Kromozomlar, sırasıyla, her biri birçok nükleotitten oluşan çok sayıda gen grubudur. Üç nükleotidin her sekansı, tek bir amino asidi gösteren bir kodondur. Bununla birlikte, sarıldıklarında, kromozomlar hücresel makineler tarafından aktif değildir ve okunamaz durumdadır. Hücredeki kimyasal sensörler, çekirdeğin çalışmaya başlaması için bir proteine veya başka bir şeye ihtiyaç duyulduğunu gösteren aktif hale getirilmelidir.
Hücrenin kimyasal duyuları bir proteine duyulan ihtiyacı gösterdiğinde, bazı moleküller çekirdeğe gider. Bu moleküller gerekli kromozomun çözülmesine neden olur ve bu da okuma için erişilebilir olmasını sağlar. DNA'nın çift sarmalının ayrılması, bir tarafındaki gerekli nükleotidleri açığa çıkarması ve ardından RNA şeklinde ters bir kopya oluşturarak okunmasıdır. Sitoplazmada protein montaj makinalarına taşınan bu RNA'dır.